Transcriptome sequencing data of major domestic animals (2020)
为描述青藏高原及周边地区(泛第三极地区)主要驯化动物遗传多样性的分布格局,厘清其相关遗传背景。2020年我们选取31个肯尼亚当地商品鸡和土鸡肾、脾、空肠RNA组织样品,提取总RNA后建库并做转录组测序。测序产生了一批180G转录组测序原始数据。为探索泛第三极地区家鸡驯化、迁徙、扩张等群体历史事件提供基础数据,并进一步探讨驯化动物对干燥等恶劣环境的适应机理提供资料。本数据集包含31个家鸡个体物种、品种、性别、表型等基本样品信息excel表,和31个家鸡个体3种组织转录组测序原始数据及MD5值。
转录组数据-个体编号,组织名称_RRA编号,使用cufflinks软件打开;样品信息-信息表,使用excel软件打开
彭旻晟. (2020). 主要家养动物转录组测序数据(2020). 时空三极环境大数据平台, 2020. doi:
10.11888/Ecolo.tpdc.271066.
[Peng, M. (2020). Transcriptome sequencing data of major domestic animals (2020). A Big Earth Data Platform for Three Poles, 2020]
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1. 2021-03-13 None 10.42.0.1 用途:10.42.0.1
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