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中科院藏东南站:色季拉山顶基本气象数据(2016-2019)

该数据为中国科学院藏东南高山环境综合观测研究站2016年在色季拉山西坡山顶架设自动气象站数据(AWS,Campbell公司),地理坐标为北纬29.5919,东经94.6102,海拔4640m,下垫面为高山草地。 数据包括气温(℃)、相对湿度(%)、风速(m/s)和气压(mb)日算术平均数据和降水的日累计值,原始数据2018年10月之前为30分钟一个平均值,此后为10分钟记录一个平均值。温湿度采用HMP155A温湿度探头测定,降雨量仪器型号为RG3-M,大气压力传感器探头为PTB210,风速传感器为05103,这些探头离地面2 m。数据质量方面:剔除了明显异常值,2019年上半年积雪导致电池损坏,数据有缺失,缺失的气温数据利用了附近站点4390m气温拟合回归矫正,已在数中标据黄,使用时请注意;降水量的监测从2019年8月开始。该数据站点为藏东南地区较高海拔的气象站,后续会不定期更新,可供研究生态、气候、水文、冰川等的科研工作者使用。

2021-01-27

中国北方温性草地地上生物量数据集(1993-2019)

本数据集以大量的地面实测草地地上生物量数据为基础,以1980s中国植被类型图划分出温性草地类型,借助Google Earth Engine平台上的Landsat遥感数据,在不同草地类型分别构建了草地地上实测生物量-遥感数据的随机森林模型,在验证可靠的基础上,对1993~2019年间逐年的草地地上生物量进行了估算,从而形成了1993~2019年中国北方温性草地地上生物量的逐年空间数据集。地上生物量定义为单位面积内地面以上实存生活的植被有机物质总量。已对原有栅格值乘以系数100,单位:0.01克/平方米(g/m²)。本数据集可为中国北方温性草地资源、生态环境的动态监测和评价提供科学基础。

2021-01-22

青藏高原东南缘人群线粒体基因组数据(2016-2019)

云南西部和东北部位于青藏高原东南,前期遗传学研究表明,该区域人群中保留着较多旧石器晚期人类的遗传印记,并且这些古老的遗传印记很可能进一步扩散到青藏高原。因此,对该区域人群的遗传学研究,有助于厘清早期人类定居青藏高原的迁徙历史。在本研究中,我们对分布于云南不同地区的傣族人群进行了遗传学研究。采用Sanger测序的方法对264个傣族个体进行了线粒体DNA高变区测序。基于系统发育思想,我们对这些数据进行质量控制,确保没有样本污染等质量问题。以修订后的剑桥标准序列参考,进行突变位点的输出。根据世界范围内的人群的线粒体DNA系统发育树(PhyloTree.org),对每个样本进行单倍型类群划分。结合已发表的其他地区的傣族人群的mtDNA数据,系统研究了傣族人群的母系遗传结构和形成机制。结果表明,不同地区的泰族人群有着较近的遗传关系,并且在这些泰族人群中普遍存在的单倍型类群(F1a、M7b以及B5a)可追溯至中国南方,提示泰族人群可能起源于中国南方,并在铁器或青铜时代向南迁徙至大陆东南亚。不同地区的泰族群体在遗传上表现出一定程度的分化,这与他们的语言和文化存在一定差异的现象相吻合,说明泰族在向南迁徙的过程中与周边人群(如藏缅语族、南亚语系等)发生了文化和遗传融合。

2020-12-22

日喀则藏族Y染色体SNP分型数据(2016-2019)

为研究日喀则藏族人群的父系遗传结构,我们采集了434个日喀则藏族个体。首先,通过SNP分型的方法,确定了每个样本的单倍群归属。其次,采用ABI 3130XL,用荧光标记引物对8个STR位点进行检测,以进一步研究该人群的Y染色体遗传多样性。结果表明,日喀则藏族人群中的O-M175频率最高(47.00%,其中O2-M122最多(41.47%)),其次是D-M174(40.78%,以D-P47(20.97%)和D-N1(16.82%)为主)。此外,还有C-M217(1.84%),R1a1- M17(1.61%),N1-LLY22G(5.76%),Q-M242(0.69%),以及E、J、K-M、T等。本数据及和去年发布的拉萨藏族Y染色体数据相整合,能够实现不同藏族人群的遗传结构的比较,进而通过系统发育以及溯祖分析,能够揭示不同藏族人群的群体历史。

2020-12-22

现代藏族人群全基因组变异数据(2020)

我们获得了30个藏族个体的全基因组变异数据开展研究,采用DNA 微阵列(DNA Array)的方法,对30个样本进行了SNP分型检测,获得每个样品约70万位点(包括核基因组、线粒体DNA和Y染色体)分型结果。首先,在提取基因组DNA后,进行DNA扩增、酶促片段化、沉淀和重悬。随后样品过夜孵育过程中和BeadChip杂交,DNA经退火得到位点特异性的50-mer探针,与某种Infinium微珠类型共价偶联。然后采用Infinium XT继续酶基延伸赋予等位基因特异性,然后进行荧光染色。采用iScan系统检测微珠的荧光其强度,Illumina软件自动执行分析和基因型识别。最后得出每个样本的SNP分型结果。基于上述数据,进行相关生物信息分析(主要包括芯片位点质控分析、Y染色体和线粒体DNA的单倍群分型分析)。结合上年度的数据,有助于从核基因组、Y染色体和线粒体DNA的角度,解析藏族人群的遗传结构,通过与高原周边人群数据的比较,可以较为全面地追溯高原人群的迁徙和定居历史。

2020-12-22

青海牧区传统放牧牦牛体重监测数据集(2018)

本数据集内容为2018年青海牧区11个高寒草甸典型区域内代表性牦牛群体体重与体尺(体高、体长、胸围、管围)性状的测定结果,所有元数据来源于中国科学院西北高原生物研究所生态中心高原动物生殖生物学学科组与青海省畜牧兽医科学院等单位联合开展的青海牧区传统放牧牦牛体重监测工作。数据集共包含1个工作簿11个工作表,工作簿名称为《青海牧区传统放牧牦牛体重监测数据集(2018)》,各工作表名称和内容分别为: 1.海晏哈勒景:海北藏族自治州海晏县哈勒景蒙古族乡167头牦牛体重、体尺数据;2.祁连默勒:海北藏族自治州祁连县默勒镇69头牦牛体重、体尺数据;3.祁连野牛沟:海北藏族自治州祁连县野牛沟乡42头牦牛体重、体尺数据;4.祁连央隆:海北藏族自治州祁连县央隆乡104头牦牛体重、体尺数据;5.祁连峨堡:海北藏族自治州祁连县峨堡镇28头牦牛体重、体尺数据;6.天峻新源:海西蒙古族藏族自治州天峻县新源镇38头牦牛体重、体尺数据;7.天峻龙门:海西蒙古族藏族自治州天峻县龙门乡100头牦牛体重、体尺数据;8.甘德岗龙:果洛藏族自治州甘德县岗龙乡36头牦牛体重、体尺数据;9.贵南塔秀:海南藏族自治州贵南县塔秀乡70头牦牛体重、体尺数据;10.河南柯生:黄南藏族自治州河南蒙古族自治县柯生乡73头牦牛体重、体尺数据;11.乐都达拉:海东市乐都区达拉乡50头牦牛体重、体尺数据。 本数据集通过对青海牧区各代表性区域内牦牛群体体重、体尺数据的测定,综合评估目前生态环境下高寒草甸传统放牧牦牛的生长性能。数据集可与《青海省畜禽品种志》(1983年)和《青海省畜禽遗传资源志》(2013年)中收录的1981年和2008年测定青海牦牛代表性群体生长性状进行比较,获得青海牧区传统放牧牦牛生长性能退化指数,从而有助于评估生态环境变化对于草食家畜生长与生产性能的影响。

2020-06-13

青藏高原中更新世晚期丹尼索瓦人的下颌化石

本数据集来源于论文: Chen, F.H., Welker, F., Shen, C.C., Bailey, S.E., Bergmann, I., Davis, S., Xia, H., Wang, H., Fischer, R., Freidline, S.E., Yu, T.L., Skinner, M.M., Stelzer, S., Dong, G.R., Fu, Q.M., Dong, G.H., Wang, J., Zhang, D.J., & Hublin, J.J. (2019). A late Middle Pleistocene Denisovan mandible from the Tibetan Plateau. Nature, 569, 409-412. 该成果是陈发虎院士带领其团队多年来在青藏高原开展过去人类活动和环境适应研究获得的又一突破性进展。研究团队分析了甘肃夏河县新发现的古人类下颌骨化石,可以确定其为青藏高原的丹尼索瓦人,建议命名为夏河丹尼索瓦人,简称夏河人。研究团队针对该化石开展了年代学、体质形态学、分子考古学、生存环境、人类适应等多学科综合分析。结果发现,该化石目前是除阿尔泰山地区丹尼索瓦洞以外发现的首例丹尼索瓦人化石,也是青藏高原发现的最早人类活动证据(距今16万年前)。该研究为进一步探讨丹尼索瓦人的体质形态特征及其在东亚地区的分布、青藏高原早期人类活动历史及其对高海拔环境适应等问题提供了关键证据。 数据提取自论文中Supplementary Tables。 数据集包含6个数据表,数据表名称和内容分别为: t1: Distances in mm between meshes generated from CT versus photoscans (PS)(扫描图与CT形成的网格间以毫米为单位的距离); t2: Measurements of the Xiahe mandible after reconstruction(对夏河人下颌重建后的测量); t3: Comparative Dental metrics(牙科指标比较); t4: Comparative crown morphology(牙冠形态比较); t5: Uniprot accession numbers for protein sequences of extant primates used in the phylogenetic analyses(用在系统发育分析中的现存灵长类动物蛋白质序列在蛋白质仓库中的唯一标识号); t6: Specimen names and numbers(样本的名称和编号)。

2020-05-01

1980年以来青藏高原草地生产力数据

数据集包含1980,1990,2000,2010,2017年青藏高原草地产草量空间分布。基于中国科学院地理科学与资源研究所具有自主知识产权的生态水文动力模型VIP(Vegetation Interface Process) 模拟了青藏高原草地总初级生产力(GPP),利用经验系数估算了净初级生产力(NPP),将NPP换算为干物质,再根据根冠比估算了干草产量。空间分辨率1公里。该数据集将为草地资源管理、开发、利用以及“以草定畜”策略的制定提供依据。

2020-02-06

1980年以来青藏高原草地合理载畜量和超载程度

数据集包含2000年,2010年,2018年青藏高原县级理论载畜量数据和1980年, 1990年, 2000年, 2010年, 2017年县级超载程度。基于地理科学与资源研究所具有自主知识产权的生态水文动力学模型VIP(Vegetation interface process) 模拟的NPP数据计算了产草量数据(1km分辨率),按照县行政区域尺度,计算县域产草量,并根据载畜量计算标准(NY/T 635-2015)计算得到县域范围内的理论载畜量。基于县级实际载畜量数据,计算了超载程度。数据将为草地恢复、管理和利用策略的制定提供借鉴。

2020-01-26

泛第三极生态系统生产力数据集

泛第三极是全球变化的敏感地区,其增温速率为全球的2倍以上,并且受到了西风和季风协同作用的影响。该地区植被如何响应气候变化,将深刻的影响区域生态安全。然而现有产品对泛第三极地区生态系统净初级生产力(NPP)的估算仍旧存在较大的不确定性。为此,本产品结合多源遥感数据,包括AVHRR NDVI,MODIS 反射率数据,多种气候变量(温度、降水、辐射、VPD)以及大量野外实测数据,利用机器学习算法,反演获得了泛第三极生态系统净初级生产力。

2020-01-24