南北极细菌分布特征（V1.0）(2005-2006)-时空三极环境大数据平台

南北极细菌分布数据集提供了南北极细菌分布特征。样品采集时间为13/12/2005至8/12/2006，包含北极3个地区52个样品（Spitsbergen Slijeringa，Spitsbergen Vestpynten，及Alexandra Fjord_Highlands），南极5个地区171个样品(Mitchell Peninsula,Casey station main power house,Robinsons Ridge,Herring Island,Browning Peninsula)。土壤表层样品采集后用液氮保存，运回悉尼实验室，通过FastPrep DNA试剂盒提取。提取后的DNA样品使用27F (5'-GAGTTTGATCNTGGCTCA-3' and 519R (5'-GTNTTACNGCGGCKGCTG-3')扩增16S rRNA基因片段。扩增后的片段通过454方式测序，原始数据通过Mothur软件分析。首先去除测序质量不佳序列，之后进行排序并去除嵌合体序列。之后计算序列之间相似度，相似度在97%以上的序列聚类为一个OTU，并定义OTU代表序列。OTU代表序列通过与Silva数据库进行比对，在可靠性大于>80%的情况下鉴定到属一级水平。本数据系统的比较了南极东部以及北极微生物的多样性，对研究微生物在南北极的分布具有重大意义。

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数据的引用

计慕侃. (2018). 南北极细菌分布特征（V1.0）(2005-2006). 时空三极环境大数据平台, 2018. doi: 10.11888/GlaciolGeocryol.tpe.0000008.file.
[Ji, M. (2018). Bacteria distribution in the Arctic and Antarctic (version 1.0) (2005-2006). A Big Earth Data Platform for Three Poles, 2018]

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参考文献

1.Siciliano SD, et al. Soil fertility is associated with fungal and bacterial richness, whereas pH is associated with community composition in polar soil microbial communities. Soil Biol Biochem, 2014, 78: 10–20.( 查看 )

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/Arctic and Antarctic soil bacteria survy 2005-2006.txt 大小：52.4 KB
格式：txt
大小：1.0 MB
浏览：2006 次
下载量：131 次
数据时间范围：2005-12-19 至 2006-12-14
共享方式： 开放获取
元数据更新时间：2021-04-19

联系信息

计慕侃

分发方：时空三极环境大数据平台

Email： poles@itpcas.ac.cn

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